依据《食品安全法》第八十条和《特殊医学用途配方食品注册管理办法》第九条的规定，特殊医学用途配方食品注册时，应提交下列材料：（一）特殊医学用途配方食品注册申请书；（二）产品研发报告和产品配方设计及其依据；（三）生产工艺资料；（四）产品标准要求；（五）产品标签、说明书样稿；（六）试验样品检验报告；（七）研发、生产和检验能力证明材料；（八）其他表明产品安全性、营养充足性以及特殊医学用途临床效果的材料。申请特定全营养配方食品注册，还应当提交临床试验报告。